Unser körpereigenes Abwehrsystem besteht im Wesentlichen aus zwei Achsen: Körperzellen (zelluläre Immunantwort) und Eiweißstoffen (Antikörper, humorale Immunantwort). Beide Bestandteile des Immunsystems werden bei einer Infektion aktiviert und helfen bei der Bekämpfung des Erregers. Da auch Impfungen das Immunsystem aktivieren, werden auch hier beide Systeme stimuliert. Zur Überprüfung des Impferfolges werden häufig Antikörpertests durchgeführt, wogegen die erfolgreiche Aktivierung der Immunzellen nicht regelmäßig überprüft wird, da es sich hierbei um eine aufwendigere Labormethode handelt.
Einige Medikamente haben einen Einfluss auf einzelne Achsen des Immunsystems und können zu einer verminderten Wirksamkeit der Impfungen führen. Dennoch ist eine Impfung in den meisten Fällen sinnvoll, da auch häufig eine Teilwirkung der Impfung schwere Krankheitsverläufe verhindern kann.